小儿腹泻病在儿科疾病防治中的重要地位，小儿腹泻病的常见病因可分为两大类，即感染性和非感染性两大类病因。
(一)感染性因素
1.肠道外感染因素
小儿有中耳炎，上呼吸道感染，肺炎，肾盂肾炎，皮肤感染或者是急性传染病时，可并发腹泻症状。
2.肠道感染性因素
细菌，病毒，霉菌和寄生虫等侵入胃肠道亦可引起腹泻，称为感染性腹泻。感染性腹泻常见的病原体是病毒和细菌。
(二)非感染性因素
1)喂养不当：小儿喂养不当，如过多或过少，喂养时机把握不当，突然改变食物成分，过早喂淀粉类食物(如刚满月即喂奶糕)或脂肪类食物，骤然断奶等，都会使孩子消化道不能适应而致腹泻。腹泻即便停止，一般需要2周才能完全修复，饮食的量或营养的增加应循序渐进。如果长以为大便好转病也就好了，立即给孩子恢复正常饮食，甚至增加饮食量或营养成分，结果使肠黏膜负担过重，引起胃肠功能再度紊乱而继续腹泻。
2)过敏性因素：有些婴儿对某些食物过敏时也出现腹泻症状，而且可能是对有些蛋白质过敏引起的，可改用其他蛋白质饮食。
3)糖消化吸收不良：少数小儿是由于先天性乳糖酶缺乏，多数是由于急性肠炎时较大面积的损伤了小肠微绒毛造成双糖酶，尤其是乳糖酶的缺乏，导致糖类吸收不良，引起腹泻。
(三)气候因素：春秋季节气温变化大，突然转冷，小儿腹部受凉，肠蠕动增加;天气过热使消化液分泌减少，口渴，吃奶过多，增加消化道负担而诱发消化不良性腹泻。
(四)遗传代谢内分泌疾病和消化道畸形
某些遗传代谢内分泌疾病(如先天性肾上腺皮质增生症)和某些肠道畸形(如先天性巨结肠)均可有腹泻表现。
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